mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTGCAGAGGCAGATGCAAC TGCATTTGCACCTGCACCTAC TGTGATAGAGCTGCATTTGCACCTGCACCTACAGAGAGGAAGATGGAGCAGCAAGCTAGCAATACGTGCTTGATCGCTATACGCTAGCTTCTTGCACACAATGTTGTTCCTGGTCCCTTCCTGATCCCTAGGTGCAGAGGCAGATGCAACTGTGTCAT CCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGCCCACGCGTCCGGTTACATATATATAGCAAAGTGATGTGTGATAGAGCTGCATTTGCACCTGCACCTACAGAGAGGAAGATGGAGCAGCAAGCTAGCAATACGTGCTTGATCGCTATACGCTAGCTTCTTGCACACAATGTTGTTCCTGGTCCCTTCCTGATCCCTAGGTGCAGAGGCAGATGCAACTGTGTCATAGACTTCACATCCATCTTTAGTTACTTACCACTATATATTCAATAAATTAGCTAGCACCCTAGTTCTCTTGCTGATTCCTTTCAAAAAAATCTTCAGTTACTTGCTCCTTCTAATCCTTTTTTATAGTTATTTCACTCCATGAAGTTTCAATCAATGAGCATGCGGCTAGCTAGATAGTTTTAAAAAATAGCATAAATAATTTTGATGATATAGATTATTCTCAGTGGTGGAGCCAGGATAAAATTATAGTGGGGGCTCCTCAGCCTTTTGGGCCTTCTAACCATCTCAGACAAAGTCTATTTTAGCTCCCTTGCAATAGATTTATGGATTTTACATTTTAAGGGGGGGGGGCCCACAGGGGGGCGCCAATGGACTATNCAGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGAACCACAACACACACCACCACCTACCGAACCACACCACGCCACAAAACAAAAACAAACAAACGACAAACAACCACCAACCCAACAGA 3 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR530 0.00000001 osa-MIR530 1e-78 -61.1 .((((((.((.(((((((((..(((((((((..((.((((((..(((((((((...((....)).((((..((..((((.....)))).))..))))....)))))))))......))))))..))..)))))))))..))))))))).)).)))))) (-61.1)