mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCTCTCCGTCCCAAAAT TTAGGGATGGAGGGAGTAGTA ATTTTTAAAAAAGTCAACGGTGTTAAACATTTAGGGATGGAGGGAGTAGTACAGTCCACTACTAGCTCCACCAGTTCATCTATAGCTAATCTAATAGCCAATTCATACAATAGTTGCTTACTATATTATTAATATATAGTCCCACCTATCATACGTACACTGCGTCTTGGAGTCCGTGCTGCAGCTGGCTACAGATCTATAGTCCGCTGCTCTTCTCTCTCATCTTTTATTTTATTAAAATATGTTTATAGCTGACTAATAGCTTGCTATTGTACCTGCTCTTATGGCACCCTCGATGTATAATACTCTCTCCGTCCCAAAATAGTTGTTTTTTTATTAAATTTTATCCT CGTATACATATAGTTCATATTTTATGTATACATATAGTTTTACATATTTTACAAAAGTTTTTAATAAGACAAACGGTCAAACATTTTTAAAAAAGTCAACGGTGTTAAACATTTAGGGATGGAGGGAGTAGTACAGTCCACTACTAGCTCCACCAGTTCATCTATAGCTAATCTAATAGCCAATTCATACAATAGTTGCTTACTATATTATTAATATATAGTCCCACCTATCATACGTACACTGCGTCTTGGAGTCCGTGCTGCAGCTGGCTACAGATCTATAGTCCGCTGCTCTTCTCTCTCATCTTTTATTTTATTAAAATATGTTTATAGCTGACTAATAGCTTGCTATTGTACCTGCTCTTATGGCACCCTCGATGTATAATACTCTCTCCGTCCCAAAATAGTTGTTTTTTTATTAAATTTTATCCTCC 3 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 0.000000000000006 osa-MIR806h 0.00000002 -69 ((((.((((((((.((((.((.....)).(((.(((((((((((((((.((.(((.....))).(((.....))).((((....((((...(((.(((.......(((((((((.(((...((((((...))))))(((((....((((((.((((.....))))..))(((........(((((.(((((........))))).)))))......))).(((.(((((......))))).)))...))))..)))))..)))..)))))))))...))).)))))))......))))..)).))))))))))))))).)))..))))))))))))..))))........ (-69)