mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTCATGCTGTAGTTTCATCT GTGAAGCTGCCAGCATGATCTG CACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGATGATGATGATCCACCTCTCTCATCTGTGTTCTTGATTAATTACGGATCAATCGATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGT GCACGAGGCCGCTTGCTGCTTTCTTCGAGTCTTCTCCAATTATTCGCCCATCTCTCTCTCTCTTCTTCCTCCTCTCCTCCATGAAAGCTAGGGAAATTAACTAAGGGCAGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGATGATGATGATCCACCTCTCTCATCTGTGTTCTTGATTAATTACGGATCAATCGATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTTGGGAGCACAGCAAAAAAAAACCCTAACTTTGTAGCCGGATTTGCATGGATTAATCTGCTAGGTAGCTCATCAGATTCTTTGAGAGTTTGCCTTGCTCTTCTGCAGATGAAGACGTAATCTTTGAACAGATGGGATTCTCAACTCTCAAGGTGAGGTAGTCATCAATCCAATCCATATACCTGCTCAAATTCAGTTTTAATTAAAGACTAGCTGCTTCTATGGAGTTAATTAGGGATCCTTTTTTATAGATCTCTCTTGATCTGTTTCTTAGTCTGTTCTTTCTTAATAAGGCATATATACCTCTTGGATTTGGATTTTCTTGAAAATTAAGGTAGTTTATGAGTTGGATGTGTTGTGTTATCTGCCCAGCCTTAATTTAACTGTGCTTCCTAAAAATTCGTTTGATTTGATGGTAGCATCTGAATTGTGAACTCATCTTTGGAGCTTGGACTTTAGACCAGGTGCCTTAATTCCTTAACATAAGATTTGGTCCATATTGTTTATGGAGCTTCTTATCAAGAAATACTCTTTTGATTAGGGAGTCCCCTTGTCACTTTCTTCAGTTGTGCAGGTACATATGACATATCTGTATTAAACTGATGACATTCATAACCAACTGTCCAAGTAGGGATTCATATCTTTCTACTAATTGCAGAATGTTTTCTTGGCTGAAGGAAGTTTATCTAACTG 1 1 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR167_1 4e-35 osa-MIR167h 2e-36 -42.5 .((.(((.(((((((((((.(((((((((((((((((..(((((..........)))))..)))).((((((.......))))))...)))))))))))))))))))))))).))).)) (-42.5)