mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC CCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGATGATGATGATCCACCTCTCTCATCTGTGTTCTTGATTAATTACGGATCAATCGATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTT GCACGAGGCCGCTTGCTGCTTTCTTCGAGTCTTCTCCAATTATTCGCCCATCTCTCTCTCTCTTCTTCCTCCTCTCCTCCATGAAAGCTAGGGAAATTAACTAAGGGCAGTGGTGCACCACAAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATGATGATGATGATCCACCTCTCTCATCTGTGTTCTTGATTAATTACGGATCAATCGATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTTGGGAGCACAGCAAAAAAAAACCCTAACTTTGTAGCCGGATTTGCATGGATTAATCTGCTAGGTAGCTCATCAGATTCTTTGAGAGTTTGCCTTGCTCTTCTGCAGATGAAGACGTAATCTTTGAACAGATGGGATTCTCAACTCTCAAGGTGAGGTAGTCATCAATCCAATCCATATACCTGCTCAAATTCAGTTTTAATTAAAGACTAGCTGCTTCTATGGAGTTAATTAGGGATCCTTTTTTATAGATCTCTCTTGATCTGTTTCTTAGTCTGTTCTTTCTTAATAAGGCATATATACCTCTTGGATTTGGATTTTCTTGAAAATTAAGGTAGTTTATGAGTTGGATGTGTTGTGTTATCTGCCCAGCCTTAATTTAACTGTGCTTCCTAAAAATTCGTTTGATTTGATGGTAGCATCTGAATTGTGAACTCATCTTTGGAGCTTGGACTTTAGACCAGGTGCCTTAATTCCTTAACATAAGATTTGGTCCATATTGTTTATGGAGCTTCTTATCAAGAAATACTCTTTTGATTAGGGAGTCCCCTTGTCACTTTCTTCAGTTGTGCAGGTACATATGACATATCTGTATTAAACTGATGACATTCATAACCAACTGTCCAAGTAGGGATTCATATCTTTCTACTAATTGCAGAATGTTTTCTTGGCTGAAGGAAGTTTATCTAACTG 0 1 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR167_1 1e-35 osa-MIR167h 6e-37 -42.6 ..((.(((.(((((((((((.(((((((((((((((((..(((((..........)))))..)))).((((((.......))))))...)))))))))))))))))))))))).))).)). (-42.6)