mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GATCGTGCTGCGCAGTTTCATC GATGTGTGCACCTTAAGCAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTTGCGATCTCTTTTTTTATCTGAATAAGTTGATGGAAATATTGGGTTCCTAAGATTCAGATCGTGCTGCGCAGTTTCATCTGCTAATCGATGCACTAC GACTCTTCACCTCTCCATTTAGCTTTGTGATGTGTGCACCTTAAGCAGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATCTTTTGCGATCTCTTTTTTTATCTGAATAAGTTGATGGAAATATTGGGTTCCTAAGATTCAGATCGTGCTGCGCAGTTTCATCTGCTAATCGATGCACTACACTGTGAATTTCTTTCTATCATATATTACTAGATATTCATTTCTAGACCTTATCTGAAGATTAGACAGAAAAAACGCAATATATAGAGTAGATCCAGACAGATCAGCTGTCTGATCGATCTTGCATGCAAAAACCCGTGGAGATTGAGATCTAGACAGATCGTACTTATGCATATATATTGACTGTTGTAATCTGCACAGGAGTCATATGCATATTGATCGATCAACCG 0 1 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR167_1 2e-55 osa-MIR167j 4e-66 -55.4 .....(((((.....(((((.((((((((((((((((((((((..(((((.((.(((..((((((((..........))))))))....))).)).))))).))))))))))))).))))))))).)))))......)))))... (-55.4)