mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGGCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC TAACTAAGGGCAGGGGTGCACCACAAGTGGGTGAAGCTGGCAGCATGATCTGATGATGATGATGATCCACCTCTCTCATCTGTGTTCTTGATTAATTACGGATCAATCGATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTTGGGAGCACAGCAAAAAAAAA GAGTCTTCTCCAATTATTCGCCCATCTCTCTCTCTCTTCTTCCTCCTCTCCTCCATGAAAGCTAGGGAAATTAACTAAGGGCAGGGGTGCACCACAAGTGGGTGAAGCTGGCAGCATGATCTGATGATGATGATGATCCACCTCTCTCATCTGTGTTCTTGATTAATTACGGATCAATCGATCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTTGGGAGCACAGCAAAAAAAAACCCTAACTTTGTAGCCGGATTTGGATGGATTAATCTGGTAGGTAGCTCATCAGATTCTTTGAGAGTTTGGCTTGCTCTTCTGCAGATGAAGACGTAATCTTTGAACAGATGGGATTCTCAACTCTCAAGCAATGATGTTAGCTAGTGATGGGAATATCACCTGAC 0 1 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR167_1 9e-37 osa-MIR167h 7e-37 -55.3 .........((....((((.(((..((((((((((((((.((((((((((((((((((..(((((..........)))))..)))).((((((.......))))))...))))))))))))))))))))))))))))...)))..)))).))......... (-55.3)