mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAAAGTCAACGGCGTCAAA TGACACCGTTGACTTTTTTAA TTTCCTAAATGTTTGACACCGTTGACTTTTTTAAACATGTTTGACCGTTCGTTTTATTCAAAAACTTTTGTGATATGTGTAAAACTATATGTATATATAAATGTATATTTAACAATAAATCAAATGATAGAAAAAGAATTAACAATTACTTAAATTTTTTGAATAAGACGAAAGGTCAAATATTTTTAAAAAAGTCAACGGCGTCAAACATTTTGGGA AGGGACAAAGCTGGGTACCGGGCCCCCCCTCGAGATTTTTTTCCTTTTTTTTTTAACCCTCAAATAACCCAATCTGATACTATTTGATTTCAGGACCTTGAAGTGCTACTCAGGTGAGCTAGAGAACATGGTTTAGTCGACACCATCCACAAATGTTTACGGATTAAATTCACAAAACTTCATCCGATTATTTACAGGCAATGCTGAATGCTCTTGCTAAAAACAAAAATGTTGGATGTAGCTCGTAAACCAGCAAAGCGTACCAGCTCTGTGCCCAAAAAGATTACAAGACTGCCAAGCTCATAGTCATATGTACATGATTTCCCTTTTCCCCACTTATATACTACTCCCTCCTTTCCTAAATGTTTGACACCGTTGACTTTTTTAAACATGTTTGACCGTTCGTTTTATTCAAAAACTTTTGTGATATGTGTAAAACTATATGTATATATAAATGTATATTTAACAATAAATCAAATGATAGAAAAAGAATTAACAATTACTTAAATTTTTTGAATAAGACGAAAGGTCAAATATTTTTAAAAAAGTCAACGGCGTCAAACATTTTGGGATTTTTAAAAAAGTCAACAGCGTCAAACATTTTGAGATGGAGATAGTATATATTTCACAGTTTAACTAAACAACCACAGTCCACAGGGATAAACAAGTAGGAAAACCGTCATTTCCCAGGTTTCGTTCTTTTCAGAGCAACAATCCTATTGGTGTAGAATATCCACCCTAGAACATAAGACAATGTCCTCCATTCTCTACACCCGGCCTTGGGCTTAGATATCGTTGCAACGAAGCCTTTCAGTGCAGCTCAAGGTCTTTGTGTGTC 1 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 9e-121 osa-MIR806h 9e-62 -77.3 .((((.(((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((.(((((((((((((((((.(((.((((((((((((..........))))))))..(((..((((........(((....))).......))))..))).))))..))).))))))))))))))))).)))))))))).))))))))))))))))).))))))))))).)))) (-77.3)