mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAAAAGTCAACGGTGTCAAA TGACACCATTGACTTTTTAGC TGAGAAATGTACTCTCTCCATTTTAAAATGTTTGACACCATTGACTTTTTAGCACATGTTTGACCGTTCGTCTTATTCAAAAAATTTTGTGAAATATGTAAAACTATATGTGTACACAAAAGTATATTTAACAATGAATCAAATGATATGAAAAGAATAAATAATTACTTAAATTTTTTAAATAAGATGAATGGTCAAACATGTACTAAAAAGTCAACGGTGTCAAACATTTTGAAACGGAGGGAGTATTTTACCA AATTTGTTTGTAATGCTTGACATGTGACCTTGCTATGCTTGAATGAGAGCTCCATTTGCCCCCATGCCGCTCAGGTAGGGATGTAACATGTTGTGACATGCAAACTGGAAGTGAGAAATGTACTCTCTCCATTTTAAAATGTTTGACACCATTGACTTTTTAGCACATGTTTGACCGTTCGTCTTATTCAAAAAATTTTGTGAAATATGTAAAACTATATGTGTACACAAAAGTATATTTAACAATGAATCAAATGATATGAAAAGAATAAATAATTACTTAAATTTTTTAAATAAGATGAATGGTCAAACATGTACTAAAAAGTCAACGGTGTCAAACATTTTGAAACGGAGGGAGTATTTTACCATAACAACGATACTTGTAGTTTCAACCC 1 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 3e-90 osa-MIR806c 6e-94 -103.1 .....((.(((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((..(((((((....)))))))...)))).(((((((((((....((.(((....))).)).......))))))..)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))).))))))))))).)).... (-103.1)