mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAAAAGTCAACGGTGTCAAA TGACACCGTTGACTTCTTATA TTAATTACTCTCTCCATTTCAAAATGTTTGACACCGTTGACTTCTTATAACAAGTTTGACCGTTTATCTTATTAAAAAAATTTATGAAATATGTAANACTATATATGTACATAAAAGTATATTTAACCATAAATCAAATAATATGAAAAAAAAATAATTACATAGATTTTTGGAATAAGACGAATGGTCAAACACGTCCTAAAAAGTCAACGGTGTCAAATATTTTAAAACGGAGGGAGTACTACATAA TTAATTACTCTCTCCATTTCAAAATGTTTGACACCGTTGACTTCTTATAACAAGTTTGACCGTTTATCTTATTAAAAAAATTTATGAAATATGTAANACTATATATGTACATAAAAGTATATTTAACCATAAATCAAATAATATGAAAAAAAAATAATTACATAGATTTTTGGAATAAGACGAATGGTCAAACACGTCCTAAAAAGTCAACGGTGTCAAATATTTTAAAACGGAGGGAGTACTACATAAACAAATAAAACTAGGCATCTGATTAACACATTATCTATCAATCGATCGATCAGTAGACGGGTATGCAGCAATCAGCATCAGCAGCATATGCGATGTGAATTGTGATGTATGCAACGGTGTATTTTTGCGGTAAATAAAGTGAAGCGGATATCTATCTATATAC 1 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 1e-46 osa-MIR806c 1e-36 -82.3 .....((((((((((.(((.(((((((((((((((((((((((.(((..((..((((((((((((.(((((((..(((((((((((...((((((............)))))).((.(((.(((...((((..........))))....))).))).)).)))))))))))..))))))).))))))))))))..))..))).))))))))))))))))))))))).))).))))))))))........ (-82.3)