mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGCTAAAAAGTCAACGGC CGTTGACTTTTTAACACATGT CAAACTATATGTCACTAGCTATATACCCCCTCCGTTTCAGAATGTTTGACACCGTTGACTTTTTAACACATGTTTAACCGTTCGTCTTGTTCAAAAACTTTTGTGAAATATGTAAAATTATATGCCTACATAAAAATATATTTAGCAATGAATCAAATGATAGAAAAAGAATTAATAATTACTTAAATTCTTTCGAATAAGACGAACGGTCAAACCATGTGCTAAAAAGTCAACGGCGTCAGACATTTCGAAACGGAGTGAGTATCAATTCGTGAGTGCAATTAAC GTAAGAACAAACTATATGTCACTAGCTATATACCCCCTCCGTTTCAGAATGTTTGACACCGTTGACTTTTTAACACATGTTTAACCGTTCGTCTTGTTCAAAAACTTTTGTGAAATATGTAAAATTATATGCCTACATAAAAATATATTTAGCAATGAATCAAATGATAGAAAAAGAATTAATAATTACTTAAATTCTTTCGAATAAGACGAACGGTCAAACCATGTGCTAAAAAGTCAACGGCGTCAGACATTTCGAAACGGAGTGAGTATCAATTCGTGAGTGCAATTAACGTTGCTTGATCATCTGATGATGATGAACACACACAGCTTCTGGAAGAGCCANCCGGAGAAGATAATATCGTGCATCGGGTCGCTGGGGAGC 2 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 8e-88 osa-MIR806h 7e-88 -91.6 .........((.((((.((.((((((...(((((((((.(((((((((((.((((((((((((((.(((((((((.((((((((((((((((........((((.((((((((....((.((((....)))).)))))))))).))))...(((....)))....((((((((............)))))))).)))))))))))))))).))).)))))).)))))))))))))).))))))))))).)))))))))...))))..))..)).))))))...... (-91.6)