mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGGTCCTGGGTTCGATCTT ATTTAATTACAAGGACTGTTGTGG TAGTGAGCTGATATTTAATTACAAGGACTGTTGTGGTCCAATGGAAAAGCGCCCGTCATGGAGCCAGAGGGTCCTGGGTTCGATCTTCGGCGAGGTC 5 3 3' arm Schistosoma_japonicum 19997615 100 100 -30.4 ......(((((.(((.((((...((((((.((.(((((((((((........))))..)))).))))).)))))).)))).)))..)))))...... (-30.40)