mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTCCCTACTCCACCCATGC ATGGGTGAGTAGGGAAGATA TGGAGAGGGAGTTGAAGGATATTGGGAAGGTTTTGGTATGGGTGAGTAGGGAAGATAATTTAACTAAGTAATAATAATATCACTTTTTTCATTATTACTATTTACTTAAGGAATTTGTATATCTTCCCTACTCCACCCATGCCATAGGTTTCCCATTATTCCTCCCTCTCCTTATCTCACC TGGAGAGGGAGTTGAAGGATATTGGGAAGGTTTTGGTATGGGTGAGTAGGGAAGATAATTTAACTAAGTAATAATAATATCACTTTTTTCATTATTACTATTTACTTAAGGAATTTGTATATCTTCCCTACTCCACCCATGCCATAGGTTTCCCATTATTCCTCCCTCTCCTTATCTCACCTCTGTTCCAAGAAGTATACTCTATATGGGTTGCTTATAATTTCATTGCCTTTGTGTTTAATTGTCTATTTTATGCTAATCATATATTTGTCTATTTGTTAATAAGGAAACATGCTTGTCTAATAAGCTTTCATACACACACACACACACACACACTAATATTTCATATATTGACACATGATTTTTCCCTCACATCCACGTTACGCACACATTTTTGTTTAAAACTTTTAACTGCGTTATTTTGATTGTACCTTTATGTATGTGTCTCATGGGATTGCCAATTAATGTTGTACCCTTGCAGGTTTTGCTTGCTGGTTCTTTGTCCACATAAACGAACCAAAAGAACAGAAAGAAAAAGGCTTAATTTAGCTACTAATTGGAATTTGAAGCAGAGAGTTCAGATAATCCGGGTCCCTGTTCCTTATAACCCCACAAAATTATGGGGTATACTTTACTGCCTCCAGTGAACGGAGCTGGCCGAATCACCTCACGCTCCCTTAAGTCTGAAACCCCAGGCTTCACCCCCTCGAATCATAACCCCTCGGTCAACCTCTACCCCCTCTCATACTAAGCAAATCTGCACCAGGCACGCATCACAACACACAATCCTCCACCTTCCTCATGCCTATCCACCAGTCCAATAACTACACCAGAGCTGGCCTCCGGTCTTACTCTGGTTGCCCGCGTCACGACTCGACCGCCTAATGCTTGCATTATCTACAGCTTATGTTCCAATCCCCCGCTACATCGCTGCCACTACACCCCATGTGCACAACAGATCGCCGCAGCTCTTCGTCCCTCTTGT 0 1 3' arm Citrus_sinensis mirnest 100 ptc-MIR472a 0.0006 -73.5 .((((((((((.....(((((.(((((((.((.((((((((((((((((((((((((.(((((.((((((.(((((((............))))))).)))))).))))).........))))))))))))).))))))))))).)).))))))).))))))))))))))).......... (-73.5)