mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACAGCCAATATTGATACCCG GGTGTTGATTCTGGCTGAGTTCGTGGCA CGATACCTGGTGTTGATTCTGGCTGAGTTCGTGGCAGGATAAAGGTTTGCCTGTCACAGCCAATATTGATACCCGGTGTTG 5 6 3' arm Schistosoma_japonicum 19997615 100 emu-mir-2c 0.001 -37.4 (((((((.(((((..((..(((((......((((((((.(((....))))))))))))))))..))..))))).))))))) (-37.40)