mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGATGTTCACAGTGGGATTTT CGTCCTATTTGGGACTCATCGGCT AGGACGAGCGTTTCGTCCTATTTGGGACTCATCGGCTTGATGTACGTGCATCCCAATGTTGATGTTCACAGTGGGATTTTAACTCAGTCC 6 2 3' arm Schistosoma_japonicum 19997615 Hammerhead_1 0.00000000008 100 -28 .(((((((......((((((((...((..(((((((..(((((....))))).....))))))).))..)))))))).....))).)))) (-28.00)