mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCTCTGTGTTGAATTTGGGTATC TATCCACTTCTTCCAGAGTTTC CCCAGGTATGTGTAGGTATCCACTTCTTCCAGAGTTTCTCCATCAAGTTCAATCGGGTCGATGCTCTGTGTTGAATTTGGGTATCTTGCTCTGGT 4 2 3' arm Schistosoma_japonicum 19997615 100 sja-mir-3486 0.00007 -27.62 .(((((((.....(((((((((.(((..(((((((.(((((.............)))..)).)))))).)..)))..)))))))))))).)))). (-27.62)