mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTCGAACTGTTGTGGCCA GTCAGCGACACCAATTGAGGTGA GACGTCCCCGTCCTCGAACTGTTGTGGCCACCGCACCTTCATCTCGTGCAGAGTCAGCGACACCAATTGAGGTGAGGAACAAT 5 3 5' arm Schistosoma_japonicum 19997615 100 sja-mir-3489 6e-42 -23.3 ....(((.((.((((((..(((((((((..(.((((.........)))).).)))).)))))....)))))))).)))..... (-23.30)