mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACAGAGACTGATCAATTCC AATTGATCAGTTTTTGTTGC GTCATGGACTGAAATTGATCAGTTTTTGTTGCCATATGTGCATCTTGAGTGGCAACAGAGACTGATCAATTCCAGTTCTTAGC 1 0 3' arm Schistosoma_japonicum 19997615 100 100 -41.62 .....((((((.(((((((((((((((((((((((.............))))))))))))))))))))))).))))))..... (-41.62)