mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATACTGTTAGGTAAAGATGCC CATCTTACTAATAGTATTTGA AGAATGAGTATGGCATCTTACTAATAGTATTTGATAAAGAATTTTCTAATACTGTTAGGTAAAGATGCCAGCTCACTTC 2 2 3' arm Schistosoma_japonicum 19997615 mir-8 0.00006 sja-mir-8 9e-38 -32 .((((((((.(((((((((.(((((((((((.((..........)).)))))))))))...)))))))))))))).))) (-32.00)