mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCACCGGGTAGACATTCAT GAATGTCTGTTCGGTTTGTG AGCAGCATCTGAAGGGAATGTCTGTTCGGTTTGTGTTATCGTGGCTACTTATTAAGTACTACTTAATAGTGTAGTTATGTTTCAGTGCACCACCGGGTAGACATTCATCCGCAGAAGTC 5 1 3' arm Schistosoma_japonicum 20092619 100 sja-mir-36 0.0004 -47.6 ....((.((((....(((((((((..((((..((((...(((((((((((((((((.....)))))))).))))))))).......)))).))))..))))))))).....)))).)). (-47.60)