mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAACCTACTTGATTGAGG TCATAAAGAAGGTTGTTTGATG AAGAAACTCCTCATAAAGAAGGTTGTTTGATGTAATATTCAATAATTAATAATAATTATTATTATTATTATTATCATTTCGATGAAATAATAATATAAAGAAGATGAATATAAAATAACTTACATCAAACCTACTTGATTGAGGGGCACTT 3 4 3' arm Schistosoma_japonicum 20092619 100 sja-mir-307 1e-19 -38.1 ......(((((((..(((.(((((...((((((((((((((.((((((....)))))).((((((((((.(((((.....))))))))))))))).........))))))).........)))))))))))).)))...)))))))..... (-38.10)