mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAAGATTACGGCGAAGCT CTTCACTTTATTTTGCCAAT ATGCTATTTGTTGTTGGCAAGATTACGGCGAAGCTGAATCAAATTTAAAATGTTTCAGCTTCACTTTATTTTGCCAATAAAGGTAGCAT 3 1 5' arm Schistosoma_japonicum 20092619 100 sja-mir-31 7e-42 -38.9 (((((((((.(((((((((((((...((.(((((((((.((.........)).))))))))).))..)))))))))))))))))))))) (-38.90)