mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGACTGGGAA CCCAGTCCCGAACCCGTCGG TCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGTCCTTTCGGGGGCCTT GGCCGGAAGAGCACTTCACGTCGCGCGGTGTCCGGTGCGCCCCCGGCGGCCCTTGAAAATCCGGAGGACCGAGTGCCGCCCGCGCCCGGTCGTACTCATAACCGCATCAGGTCTCCAAGGTGAACAGCCTCTGGTCGATGGAACAATGTAGGCAAGGGAAGTCGGCAAAATGGATCCGTAACTTCGGGAAAAGGATTGGCTCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGCGGACTGCTCGAGCTGCCACCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGTCCTTTCGGGGGCCTTCCCCGGGCGTCGAACAGTCGACTCAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGTCCCTGCGGATGCTCACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTGTCTACTATCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTCCGACTTTGTGAAATGACTTGAGAGGTGTAGTATAAGTGGGAGCCGGAAACGGCGAAAGTGAAATACCACTACTTTTAACGTTTTTTACTTATTCCGTGAATCGAAGGCGGGGCACTGCCCCCTCTTTTTGACCCCAGGCCCCCTTCACGGGGGTCGATCCGGGCGGAAGACTTTGGCCGGGGGGGAGTTTGGCTGGGGCGGCCCTTTTGTTAAAAAATACCGCGGGTGTCCTAAAAAGAACTTCACAAGAACAAAAATTCTCGGGGGGAACAAAAGGGAAAAAGTTCTGTTTGATTTCTAATTTTCATTAAAAATACCAAACCTGGACCGGGGGCCTTGGGGGGGTTTTANC 5 1 3' arm Citrus_sinensis mirnest 100 peu-MIR2911 2e-34 -74.5 ((((...((...)).))))..(((((((((....(((((((((((.((((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))))).))))).))))....)))))))))..((((((....)))))).. (-74.5)