mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAGGAATGGCTTGCCTA GTGAGCCTTCATGGCTAAG TTAAGCAGAGTAAACTTGTGAGGAGGGTAGCCTTACATGGAGATGAGGAGATTGCCTCTGTTAGCCAGGAATGGCTTGCCTATCTCCACTATTTGGTTCATCACTGGAACACACTTGGGGTTCTCAGATGGTGGATGAAATATGGAAGATGGTGAGCCTTCATGGCTAAGAGAGTGATTCTCATCCCCCATGCTAGGCTGTATCCCTCTTTCTAGCTCTCAACATCTC AAGCAATTAAGGGCAGCTTATTAAGCAGAGTAAACTTGTGAGGAGGGTAGCCTTACATGGAGATGAGGAGATTGCCTCTGTTAGCCAGGAATGGCTTGCCTATCTCCACTATTTGGTTCATCACTGGAACACACTTGGGGTTCTCAGATGGTGGATGAAATATGGAAGATGGTGAGCCTTCATGGCTAAGAGAGTGATTCTCATCCCCCATGCTAGGCTGTATCCCTCTTTCTAGCTCTCAACATCTCGCGATCTTCGGTAGGTGATTCTTTCAGTTCTTTGATCTAATTCTAGGTAAGATTCCATTCTTCAGATCATCCATCACAAATTCAGAGGTATGGTGTGAAGAATTGAGGTGATAAGGGAAGTACAGAAAGGCTTGAAATGCAAGCTGAAAAGGAACAGTGATATGTTCTTGAAAAGATGGAACTGCTCAACTCCTCATTTGTTTCTCCTTCTCCTAAGCTGTGGAATATGTGTTGTCATTGCATCAAACCATTTCCGATGACACGCCATTTTAAGCCAAATAATTTGGTTCTGATAATTATTCACTCTCATATCATTTCATTGCATAACTTAGTAGTAACAATGCATATGGTTGAGAATATCATTTTAGTGCTTTATGTGGAGAATGAGCTCCCAGGCAAATGGGAGGGGAAAGTGATTTCTGACCGCGTACTTGTTGAAAATGAGCTGCCTTGGCCGGGCTTGCCTTAGCTCTCTCATTCCAAACTAAAGACCTTTTATATCTTTGTAAATATTTGGTTTTTCCATGATGATATTCATGGGCTTTCTCGGGCCTAGACCCTGTGCTGGAGCCCTAGCAGAGAGTTCAGGCTCATCTTGGCCCCTGTAAACCTCTCCAGATGGTACTAGTTACTACAAAAGCTGAAAATACATATTTTTGCCAGCCAGAAATTTTGACCATCATATCCTGTTCCTTTCAAAAATGCGATCCATCAAGTTTCCCCAAAGGTTTAAAAGAATTAGTACTGATGAAAGTGAAAAAAAATATTAATTGATTTTTCCTGGTTTGAAGAAACAAAGAAACCAATGTCCTTTTTTAGAAAATATATTGCATAAGGGTATTTGGTGCCCTTTTTGTGCACGTTTAAACAATTTAACAGAGGGTTTTCCAAGAAATTTACCCCTTTAAAAATTTTAAAAAAAAATATTTAACAATTTTTTTCCCCCCATATTTTTTTTGGGGGTTTTTTGGGTTGTCCACAACCCCCACCACAATTTTTTCTCTCCCCTCCACGGGGCAAAAAAATTACTCCCCCGTGGGCCGACAAAAAAAAAAAAATATAACCAA 2 1 5' arm Oryza_sativa mirnest 100 osa-MIR1430 7e-72 -85.2 .......(((.....(((.((((((((((((((..(((((.((((((((......((((.(((((((.(((.((((((((.(((((((.(((((.(((((((((((((((.........)))).))).)))))))).)))))))).))))))))))))))).))))))).))))...))))))))..)))))..))))))...)))))))).)))..)))........ (-85.2)