mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGTCTGGCTCGAGG GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGCCACTAACTAGATCTTTGATTTAATCTCAGTTGATCATATATTTGTTTCATTTTTCTTCCATAAAATTTAATTATATTGAGATACCCATCATTGATCTTAAGATAATTAAGTTAGTGACGTCGGACCAGGCTTCATTCC 4 0 3' arm Citrus_sinensis micropc mir-166 0.000000002 ctr-MIR166 1e-87 -49.61 ((((((..((((((..(((.(.(((((((((((((..((((...((((((((((((..((.((((...................)))).)))))).))))))))....))))..)))))...........)))))))).).)))..))))))..)))))) (-49.61)