mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATAATAATAATAATG TTATTCTTATTCTCATTATT CATTATTCTTATTCTCATTATTACCATGCACAAAGGTTATTATTATGGTTACTGTGTTTCTCAATCTTTCTTCATCTTCTAATAATAATAATAATG 1 3 3' arm Gossypium_hirsutum micropc 100 100 0 (((((((.(((((...((((.....(((...(((((((.....(((((...)))))......)))))))...)))....))))))))).))))))) ( -7.60)