mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG GGGGCAACCTGAGATCACATA CAGGGGCAACCTGAGATCACATATTGTCATTTTTCTTTAGTTGTTGAGTCTGGTTCAATATCTCACTATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG 2 0 3' arm Nicotiana_benthamiana micropc MIR398 0.0003 bdi-MIR398c 0.00002 -39.9 (((((((.((((((((.((((((.((............((.(((((((.....))))))).)))).)))))).)))))))).))))))) (-39.90)