mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGAGAGCACA TGTTTTTTTTTTTTTTTTTTA ACGGCATGACAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACAACAAACCAACATTCTAGTCTTGAGAATAAGTTCATTGCAGCAGGATTTTCAAGAAGAGAATCCAGAATTATTATATGGAAAGATAACAACCTCTTAGTGACTTACTACTCCCAATGAAAGGGAATTGTTTGAGGGGTATCACTGGCTGCGGACCCATCATATCCCAAATGAAACACTCCAGGGCAATGAACATTATCATCCTGATCACTGGATACCAGAACAGATTCCATGGGCTCTACACTGTGATTATGCAGGCTTGTGCCCAAGGACCGCACCAGTGGCATTGAACTAGGCGGCATCATTTGGCTCAAACTGATACCAGATGTCTGTGTTGTTGGTGATGACAGAAGAGAGAGAGCACAATCTGAGTC CGCTACGTAACGGCATGACAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACAACAAACCAACATTCTAGTCTTGAGAATAAGTTCATTGCAGCAGGATTTTCAAGAAGAGAATCCAGAATTATTATATGGAAAGATAACAACCTCTTAGTGACTTACTACTCCCAATGAAAGGGAATTGTTTGAGGGGTATCACTGGCTGCGGACCCATCATATCCCAAATGAAACACTCCAGGGCAATGAACATTATCATCCTGATCACTGGATACCAGAACAGATTCCATGGGCTCTACACTGTGATTATGCAGGCTTGTGCCCAAGGACCGCACCAGTGGCATTGAACTAGGCGGCATCATTTGGCTCAAACTGATACCAGATGTCTGTGTTGTTGGTGATGACAGAAGAGAGAGAGCACAATCTGAGTCTTGAGTGGTTGACCTGTCATGGAATACATTGTGGCTTGCCCCACTTCGGTCTGACAAATTGGCAGTGCCAAGAAGCGGCTGGCTGACAGAAGCTTCAGAAGAT 3 0 3' arm Citrus_unshiu mirnest mir-156 0.0004 sbi-MIR156d 0.0000003 -97 ..(((..((..((((((((((((((((.((..........(((((((((((.......))))..((((((.(((....((((((((.....))))))))....(((((.........)))))..((((((((..(((.......((((.......))))...)))))))))))..((((((.(((((.....((((.......)))).......(((((...(((......))))))))(((.((((...))))....)))(((.(((((......((((......))))......))))).))))))))))))))))).))))))..((((...(((((((.(((...)))..))))))).))))..)))))))...)).))))))))))))))))..))...))) (-97)