mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTTTATGCTTCTGTCA TTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGGTGTGCAATTAGGAGTCTTGAAGCAATGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTTTATGCTTCTGTCA 1 1 5' arm Gossypium_raimondii micropc 100 gra-MIR157a 3e-47 -43.2 .(((((((((((((((((((((((.(((((..((((.(((((...))))).....))))..))).)).)))))))))))))).))))))))) (-43.20)