mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCTGTCCTTGGCT AGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGAACCTGGAGGCGTCTCAGCTTGCTGTGCTGAGGCTTAGAACTCAGTCGGCAAGTCTGTCCTTGGCT 1 1 5' arm Zea_mays micropc MIR169_2 8e-42 zma-MIR169c 4e-43 -53.4 (((((((((((((((((((.((((.(....).))))..((((((((.......))))))))............))))))))).)))))))))) (-53.40)