mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGCGCCAATATCA ATGTTGGTGAGGTTCAATC GATGTTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGGATTTACGAATTGATTCAGTCGTAAAATACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCA 2 0 3' arm Gossypium_hirsutum micropc MIR171_1 6e-24 tcc-MIR171c 1e-36 -39.5 ((((((((((.(((((((((.((.((((..(((((((.(((...))))))))))...)).)))).))))))))).)))))))))). (-39.50)