mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCC AGCTCCCTTCAATCCAAGA GGAGCTCCCTTCAATCCAAGAAATGCGTGTTTAGTGACAGTACATCTCCTGCGTCATGCACACCACTATCCTGTCATGCAGGTCGATTGATTGATTTGTTCAGGCTGCTGGAGAGTCACGGACAGGGAAGTAGAATGCATGAATCAGCAGCTGAACCACCGCTGCACAAGCTTTGGTTGGACTGAAGGGAGCTCC 1 0 3' arm Pinus_taeda micropc MIR159 0.0002 pta-MIR319 2e-108 -84.4 (((((((((((((.(((((..((.((.(((.(((((...((...((..((((.(((((((..(.(((.(((((((..(((((((((....)))))))))...((((.......))))...))))))).))).)..)))))))....))))..))))...))))).))).)).))..))))).))))))))))))) (-84.40)