mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGACTGAAGGGAGCTC GCTTTCTTCAGTCCAAACA GAGCTTTCTTCAGTCCAAACATGGGTGGCAGTAGGATTCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATGCTGAGATGAGATGACGATGAACCCGGCCTTGATGACTAATGAACACTGTCTCAGTAACTGAGTGAATGATGCGGGAGACAAGTTGGATCTTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTC 3 0 3' arm Ipomoea_nil micropc MIR159 6e-26 rco-MIR319a 3e-27 -84.4 (((((..(((((((((((..(((((.(((..((((((((((((.(((((((..(((((((..((..(((((((((.((....((.......))...((.((.....)).))..)))))))))))..))..)))))))..)))))).).)))))))))))).))).)))))..)))))))))))..))))) (-84.40)