mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACT TTCAACAAAGCTGTGGGA TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATGGTTCAATGTTGATCTGTTGGATCTGTGTTGTTTTTTTGGCTTAAATCTTTGCAGTTCAACAAAGCTGTGGGA 1 0 5' arm Carthamus_tinctorius micropc MIR396 0.000005 aqc-MIR396a 0.00000002 -40.11 ((((((((((((.((((((((((.(((((((..(.((((.....)))).)..))).............))))..)))))))))).)))))))))))) (-40.11)