mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCT AGCTCCTTGAAGTCCAATAG GGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTTGCTGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGCCCTATCTCATAATAAAGACTCTAGTCTTCTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTCTTATGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCT 3 0 3' arm Manihot_esculenta micropc MIR159 3e-46 rco-MIR159 2e-47 -87.4 ((((((((((..(((((((..((((((((.((.((((((...(((((.(((((.((((.(..((((((.((((((.((.....(((((....)))))..)))))))).))))))..).)))).))))).)))))..)))))).....)).))))))))..)))))))..)))))))))) (-87.40)