mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGAGATGACGTGGACGAATA TTTATCCATGTCACCTAGAGT GAGATTTATCCATGTCACCTAGAGTGGCAGTAAAAAAAATTTCATGAATAACTCTCAGATTTAACCATGGGTTAAAAATTTTATTCGAGATGACGTGGACGAATAC CATCCTCTTCTTATGAAGAAGCTACAAGGCAGGACTGGCGCTGCCTGGGAAAGGATTCGCTCCATCCAGCGACTAGAAATCGTTTAAACTCAAGGTGGGAATGGTCTTAAGCAAGTGGTACTAGGTATCAAGGGGAAAGGCAAGACCAACAGCATAGCGCAAGTGTCACTGCTCGGTGGTCATCACGCTTAACGACCTCTGCTGAATTTGGTTCTACGGGACTTGTTAGATGGGGAAAAATATAAAGTGCAAACCACATATACAGTGACAACTTAGAAACTAATATTAGCATAAAAATGAATGTATGAGATTTATCCATGTCACCTAGAGTGGCAGTAAAAAAAATTTCATGAATAACTCTCAGATTTAACCATGGGTTAAAAATTTTATTCGAGATGACGTGGACGAATACCC 4 0 3' arm Oryza_sativa mirnest 100 osa-MIR2862 0.0003 -22.7 ...((((.(((((((((.((.((((((.............((((((..(((.((...)).)))..)))))).........)))))).)).))))))))).)))).. (-22.7)