mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAATGAAGTGCTTGAATT TTTTCCACTTCTCAATTTCCAG AATTTTCCACTTCTCAATTTCCAGGGCTTAATTTCTTGATCCTTCCGTTATTTTGATTCCTAGATTTTGGAAGGCTTGAATATAAGATTGTATGCATGAAATGAAGTGCTTGAATT 3 4 3' arm Citrus_clementina micropc 100 100 -24.3 (((((..((((((...(((((....((.((((((.(..(.(((((((..((((........))))..))))))).)..).....))))))...))..)))))))))))...))))) (-24.30)