mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGATTTGCCCTG GGGCAACTCTCCTTAAGCAAA CAGGGCAACTCTCCTTAAGCAAAAATGGATGTGCTTTTCTTTGCATAATTCGATTTTGCCAAAGGAGATTTGCCCTG 3 0 3' arm Gossypium_hirsutum micropc mir-399 0.000000001 ghr-MIR399d 2e-38 -39.1 ((((((((.(((((((..((((((.(((((((((........)))).))))).))))))..))))))).)))))))) (-39.10)