mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTCCCTACTCCTCCCATT TGGAAGGATAGGGTAAGACT TGGAAGGATAGGGTAAGACTAGGGTTAAGCAGAAACTCTGCTTCATTAATTCTCTGCTCCAGTCTTCCCTACTCCTCCCATT 3 2 3' arm Pinus_pinaster micropc 100 pta-MIR482b 2e-41 -33.42 (((.(((((((((.((((((.((((.((((((.....))))))............)))).))))))))))).)))).))).. (-33.42)