mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCT AGCTCCTTGAAGTCCAATA GGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGGTCTTACTGGGTAGATTGAGCTGCTGACTTATGGATCCCACAGCCCTATCCCGTCAATGGGGGGCATTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGCTGCATTATCCAAGTTTAAATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCT 2 0 3' arm Vitis_vinifera micropc MIR159 7e-90 vvi-MIR159c 4e-91 -79.4 ((((((((((..(((((((..((((((...(((((((((..((((((.((((..((((.(..((((((.(((((((.(((.......)))...))))))).))))))..).))))..)))).)))).)))))))).)))....))))))..)))))))..)))))))))) (-79.40)