mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG ATGCTACCCCTCGCTGGCTCTCCTGTGCCTGCCTCTTCCA TGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCACGAGGCTTGGCTAAAAGCCGACCTGTGCTATGCTACCCCTCGCTGGCTCTCCTGTGCCTGCCTCTTCCA 3 21 5' arm Saccharum_officinarum micropc 100 ssp-MIR528 3e-47 -49.2 .((((((((((.(((.((((((((.(((.(((((.....))))))))))))...((((........))))..)))).))).)))))))))). (-49.20)