mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGATGACCATCAACAAAC TTGTTTATGGTCATCTAAGC GTTTGTTTATGGTCATCTAAGCCATTTTTCATCTCGCCAATTCTTTGTTCAAGCAGTTTTTGGATAATCGAACCGATAGAATACACCCGCAGAAATGATGTTTAGATGACCATCAACAAAC 1 0 3' arm Gossypium_hirsutum micropc 100 ghr-MIR827b 2e-64 -37.5 (((((((.((((((((((((((((((((((......((((....((((....))))...))))...((((...))))...........).)))))))..)))))))))))))).))))))) (-37.50)