mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTAAAGTCCAATA TGGAGCTCCTTAAAGTCCAATAGAGGATCTTGCAGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATACCACAGCCCTATCCCATAATAAAAGGGAGTTCTTTTTTTCAAGTCTTCTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCTGGAGCTTCATTACCTTATTATGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA 2 0 3' arm Manihot_esculenta micropc MIR159 6e-26 rco-MIR159 3e-27 -85.1 (((((((((((..(((((((..((((((((.(((((((((...(((((.(.(((.((((.(..((((((.(((((((.........((((((..(((......))).))))))))))))).))))))..).)))).))).).)))))..)))))).....))).))))))))..)))))))..))))))))))) (-85.10)