mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTGAAGTCCAATA GAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGGTCTTACTGGGTAGATTGAGCTGCTGACTTATGGATCCCACAGCCCTATCCCGTCAATGGGGGGCATTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCAAGAGCTGCATTATCCAAGTTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTC 2 0 3' arm Vitis_vinifera micropc MIR159 1e-88 vvi-MIR159c 6e-90 -77.9 (((((((((..(((((((..((((((((.(((((((((..((((((..(((..((((.(..((((((.(((((((.(((.......)))...))))))).))))))..).))))..)))..)))).)))))))).)))..))))))))..)))))))..))))))))) (-77.90)