mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCT GAGTGACACTAAGAACACATA AGGAGTGACACTAAGAACACATATGGTTGAATTGCTATCTCCAGTGTATATTCATATGTTGTCAGTACAAATTTTTGATGCACATACAGTTGTTTGTGAGACATTGTCGACCATCCATTTGTGTTCTCAGGTCACCCCT 2 1 3' arm Lactuca_perennis micropc MIR398 0.0005 aqc-MIR398a 0.000002 -43.39 (((.(((((.((.((((((((.((((((((..((...((((..((((((.........((((....)))).......))))))..((((....))))))))))...)))))))).....)))))))).))))))).))) (-43.39)