mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGACTGAAGGGAGCTC GCTTCCTTCACCCACTCA GAGCTTCCTTCACCCACTCATGGAGGAGAACTGGGGTTGAATTAGCTGCCGCCTCATTCATCCAACCACTCAGTAGAAAGGAATAGGTTTTGTGCTACTGTGATTGAGTGAATGATGCGGGAGATAGTTTTCTATTCCTCTCTTTCCTTGCTTGGACTGAAGGGAGCTC 3 1 3' arm Nicotiana_tabacum micropc MIR159 5e-17 ptc-MIR319f 4e-17 -72.1 ((((((((((((.(((..((.((((((((...(((((.((((((.((.((((.(((((((..(((.(((..(((((...((((....))))...)))))))).)))..))))))).)))).)).))))))...))))))))).)))).))..)))..)))))))))))) (-72.10)