mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATCTTCATCATCATCGTC TGATGATGATGATGATG CATCTTCATCATCATCGTCGGGAATCTCGGGATATGCATCTGCCATGTCTCTACGTGATTTGGATCATCACTATGATGACGATGAGGATGATGATGATGATGATG 1 0 5' arm Raphanus_raphanistrum_subsp__raphanistrum micropc 100 100 -41.7 ((((.((((((((((((((..(((((.((((((((((....).)))))))...)).)))))...(((((.....))))).......)))))))))))))).)))) (-41.70)