mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAACA TGGAGCTCCTTGAAGTCCAACAAAAAATCTAACAGGTTAAATTGAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGCCCTATCTATTTATGATTTCAAACATATAGATAGGTTTGTGGGTTTGCATATGTCAGGAGCTTTATTTTACCCTTTGTTTGATCATTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA 2 0 3' arm Solanum_lycopersicum micropc MIR159 8e-90 sly-MIR159 2e-93 -75.2 (((((((((((..(((((((.(((..(((.(((((((.((((.(((((.(((((.((((.(..((((((.((((((((..((((........)))))))))))).))).)))..).)))).))))).))))).)))).)))...)))).)))..))).)))))))..))))))))))) (-75.20)