mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGCCGAACCAATATCACTC TTGGTATTGTTTCGGCTCAT GGTTTGGTATTGTTTCGGCTCATGTCGTTCACACAGATGTGAGCCGAACCAATATCACTC 4 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR171_2 4e-27 osa-MIR171h 2e-28 -29.2 ....((((((((.(((((((((((((.........))))))))))))).))))))))... (-29.20)