mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAAC TCAAGAAAACTGTGGGA TTCCACAGCTTTCTTGAACTTTACGTGTACGGGACGAGGAGATTCTGATTTCTACGTCTGCGATTAAAGTTCAAGAAAACTGTGGGA 1 0 5' arm Pinus_taeda micropc MIR396 1e-40 pta-MIR396 3e-44 -40.9 ((((((((.((((((((((((((..(((...(((((.((((((....)))))).))))))))..)))))))))))))).)))))))) (-40.90)