mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGGAGTGAAGGGAGCTCCA GAGCTCTCTGAACTCCAAGTC AACTGCAATTAGGGTTTTAATGGAGCTCTCTGAACTCCAAGTCTGGAAGGAGGTGATGGTAGGCCACGGCTGCTAGTCCATGAACACCCGTGGTTGCGCAGACTCAATACTGTGGCGCAGTCTAAGGGTTTGCATGAACTGGGAGACGAGGCTACCTTGATCTTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCATTCATGGACATCTCATTAT GATAGCTTTGAAGTTTTAGCATTACAATATTATGTTGGTGCAATGAAGTTTGTTTAGTAGTTTAGAAACTGCAATTAGGGTTTTAATGGAGCTCTCTGAACTCCAAGTCTGGAAGGAGGTGATGGTAGGCCACGGCTGCTAGTCCATGAACACCCGTGGTTGCGCAGACTCAATACTGTGGCGCAGTCTAAGGGTTTGCATGAACTGGGAGACGAGGCTACCTTGATCTTTTTGGTATTGGAGTGAAGGGAGCTCCATTCATGGACATCTCATTATTCTAACTGGCCTTTCCCCTGAAATATTTATATTGTTCTGCGTTATCTTTCTTCCAGGTACTGAAGGGCTCTTATTGGCTCAACAATCAAGTTACTGATATGCACCCACCAGATCAAGAACGCTAGCTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTAATTCACTTTTAAGTTAATTTACATGTTAATAAACTCTTCATGTACTTGACGATGTGGCATGTTTTCGGTCGTTGGCTTCACTACTCTATTTTGGTAGTAAGAGTATCACTGAAAAGAAATTCTTTTAAAC 3 0 3' arm Citrus_unshiu mirnest MIR159 6e-20 gma-MIR159b 8e-16 -81.2 ......(((.(((((((.(((((((((((((..(((((((..(((((((((..(((.(((((.((.((.((.(((((.((((...((((.(((((((((..((........)).)))))).))).))))...)))).))))).)).)).)))))))))).)))))))))..)))))))..)))))))))))))...)))).))).))).. (-81.2)